Sunucuda birden fazla java yüklü olabilir mi? PATH'i kontrol edin? Windows komut satırında başka bir java versiyonu ile, çift tıkladığınızda farklı bir java versiyonu ile uygulama çalışıyor olabilir.
Windows'ta uzantıları hangi uygulama ile çalıştıracağı kayıtlıdır. Sizde jar dosyaları için farklı java versiyonu seçili olabilir.
Bu arada console'da java diye çağırdığınızda, gelen java versiyonu (yanlış hatırlamıyorsam) PATH değişkeninde bin dosyası kayıtlı olan java versiyonudur.